两种锥虫侵入人体以后的基本过程包括：初发反应期和血淋巴期，以及侵入中枢神经系统的脑膜炎期。
初发反应期：患者被舌蝇叮咬后约1周，局部皮肤肿胀，中心出现一红点，即锥虫下疳。
血淋巴期：锥虫进入血液和组织间淋巴液后，引起广泛淋巴结肿大。虫血症高峰可持续2—3天，伴有发热、头痛、关节痛、肢体痛等症状。此期可出现全身淋巴结肿大，尤以颈后、颌下、腹股沟等处者明显。颈后三角部淋巴结肿大(Winterbottom氏征)为冈比亚锥虫病的特征。
脑膜脑炎期：常见病变为弥漫性软脑膜炎，脑皮质充血和水肿，神经元变性，胶质细胞增生。主要临床症状为个性改变、呈无欲状态。出现异常反射，如深部感觉过敏、共济失调、震颤、痉挛、嗜睡、昏睡等。
冈比亚锥虫病呈慢性过程，病程可持续数月至数年，症状较轻，可出现中枢神经系统异常。
罗得西亚锥虫病则呈急性过程，病程为3-9个月。患者多表现显著消瘦、高热和衰竭。有些病人在中枢神经系统未受侵犯以前就已死亡。
诊断
涂片检查法：取患者血液涂片染色镜检。也可取淋巴液、脑脊液、骨髓穿刺液、淋巴结穿刺物等作涂片检查。
血清学诊断方法：常用酶联免疫吸附试验(ELISA)、间接荧光抗体试验、和间接血凝试验等方法。
分子生物学方法：PCR、DNA探针技术。
一期梅毒(硬下疳)：一期梅毒也叫原发性梅或初疮，其临床损害为硬下疳与近卫淋巴结肿大。硬下疳病人不论就忌讳或预后而言，都极为笨重。早期梅毒病人虽然传染性最大， 但较易诊断、治疗，倘能早期确诊，及时给以有理治疗，既可完结贯彻治愈，又可免于播音和危害社会的目的。因而对于一期梅毒必须格外讲究。
疳积：是小儿时期，尤其是1～5岁儿童的一种常见病证。是指由于喂养不当，或由多种疾病的影响，使脾胃受损而导致全身虚弱、消瘦面黄、发枯等慢性病证。疳证与麻疹、惊风、天花并称为儿科四大证。但古代所说之“疳积”已与现代之“疳积”有了明显的区别，在古时候，由于生活水平的限制，人们常常饥饱不均，对小儿喂哺不足，使脾胃内亏而生疳积，多由营养不良而引起，也就是相当于西医所讲的“营养不良”。而现在随着人们生活水平的提高，且近来独生子女增多，家长们又缺乏喂养知识，盲目地加强营养，反而加重了脾运的负荷，伤害了脾胃之气，滞积中焦，使食欲下降，营养缺乏，故现在的疳积多由营养失衡造成。
预防方法：避免病媒蚊的叮咬。
具体作法：(一)流行地区居家环境及家畜喷洒杀虫剂。 (二)避免前往有大量采采蝇的地区;旅客如须前往，应尽量穿着长袖及长裤以覆盖身体外露的部份，避免穿着会吸引采采蝇的蓝色衣物。 (三)家中加装纱窗、纱门。 (四)使用及睡在蚊帐内。 (五)加强卫生教育宣导如何避免病媒蚊叮咬的重要性。 (六)加强洗手。 (七)病人住院期间，医疗工作人员应采标准防护措施，加挂蚊帐，碰触血液、体液前后应用消毒剂洗手。 (八)清除中间宿主采采蝇的栖身地，如河边灌木丛。 (九)做好检疫，找出感染源加以扑灭。
