免疫调节是指免疫系统中的免疫细胞和免疫分子之间，以及与其它系统如神经内分泌系统之间的相互作用，使得免疫应答以最恰当的形式维持在最适当的水平。免疫调节可比喻为机体的交响乐队，配合好--识别和清除抗原，对自身成分产生免疫耐受，维持内环境的稳定。配合差--病原微生物感染、肿瘤、自身免疫病、免疫缺陷病、超敏反应。
1、自身调节：免疫系统内部的免疫细胞、免疫分子的相互作用。
2、整体调节：神经内分泌系统和免疫系统的相互作用。
3、群体调节：MHC的种群适应性
免疫应答作为一种生理功能，无论是对自身成分的耐受现象，还是对“非已”抗原的排斥都是机体的免疫调节机制的控制下进行的。免疫调节机制是维持机体内环境稳定的关键，如果免疫调节功能异常，对自身成分产生强烈的免疫攻击，造成细胞破坏，功能丧失，就会发生自身免疫病。如果对外界病原微生物感染不能产生适度的反应(反应过低可造严重感染，反应过强则发生过敏反应)，也可造成对机体的有害作用。因此，免疫调节机制不仅决定了免疫应答的发生，而且也决定了反应的强弱。这一调节作用是精细的、复杂的。调节功能是作用于免疫应答过程中的多个环节。
机体的免疫功能常常用亢进或低下来描述，亢进、低下对于机体来说都是有害的。人的身体健康与否，取决于机体的免疫功能保持相对的自身稳定，即免疫功能的相对平衡。T细胞亚群中TH和TS细胞的相互作用形成了T细胞网络，对机体免疫应答的调控和维持免疫平衡稳定起着重要作用。TH--即辅助性T细胞，是T细胞的一种功能性亚群，具有辅助B细胞及其他T细胞功能活性的作用，它除了表现出免疫应答的作用外，也能诱导其他T细胞亚群活性的活化。TS--即抑制性T细胞，它的功能是抑制体液和细胞免疫应答。这两种T细胞亚群各具有独特的功能，不能相互转变。然而，却能通过它们间的相互作用而完成免疫调节作用，维持内环境的平衡稳定。
双向免疫调节，是指体内各种因素对免疫应答(肌体对外侵物质产生杀伤效应的过程)进行正负双向调节的作用。籍此使免疫应答适度，以维持肌体内环境的相对稳定。双向调节表现在：1、在排除外来抗原异物时，激活并加强免疫应答反应;2、外来抗原物质排除后，可使免疫应答自限减弱以至终止。所以说免疫系统也是一柄双刃剑：它即能排除外来因素(异己)的侵袭，从而保证了我们的生命，又能因免疫系统的阴差阳错导致疾病的发生，在免疫调节功能紊乱时，对外来入侵物质不能正常反应、清除，会降低肌体的抗感染、抗肿瘤能力，或者对"异己"抗原产生高免疫应答性从而导致超敏感性，易造成肌体组织的免疫损伤，发生变态反应性疾病，我们把前者称为"抑制"，后者称为"超敏"。
有时免疫系统也会打破对自身物质的不反应，而出现排斥自己的效应，则形成所谓自身免疫现象，如果造成了组织损伤，则可发生自身免疫性疾病，如类风湿性关节炎、红斑狼疮,类风湿性心脏病等。
