生理上指喉咙，包括咽、食管上部、喉及气管的通向胃和肺的通道，颈的前方上部紧接面颊的部分，也用以比喻形势险要的交通孔道。 咽喉是进行饮食、呼吸、发声音的器官。咽喉上连口鼻，下通肺胃，是连接口腔和肺胃的通路，又为经脉循行的要冲。
咽喉的主要生理功能有以下几点： 呼吸功能 咽喉不单只是呼吸时气流出入的通道，它对吸入的空气还有温湿度调节和清洁作用。同时，在大脑的调节下声门作为空气出入肺部的必经之路，可根据人体生命活动需氧量的增减而发生宽窄变化，入声门在人平均呼吸时较小，运动或情绪激动时，声门扩张，以便增加肺部气体交换。 发声功能 正常人发生时，先吸入空气，声带内收，拉紧，声门闭合，当气流自肺部呼出冲击声带时，使之震动而发出声音。经过咽腔和口腔改变形状，鼻腔与胸腔参与，产生共鸣，使声音清晰，和谐悦耳，并有软腭、口、舌、唇、齿等协同作用，形成各种语音。声调的高低取决于声带的长度、张力和呼出气流的力量。 免疫和保护功能 咽部有扁桃体，特别在儿童期，是个活跃的免疫器官。对从血液、淋巴或其他组织侵入机体的有害物质具有积极的防御作用。幼儿3~5周岁时，因接触外界便应原的机会较多，扁桃体显著增大。故此年龄段的孩子扁桃体肥大应视为正常生理性现象。青春期后，扁桃体的免疫活动趋于减退，组织本身也逐渐缩小。腺样体也是个免疫器官，但作用较小。
