梅毒初期，治了两次阳性不能转阴可能是由于梅毒螺旋体没有被彻底治愈。

　　梅毒螺旋体是一种结构复杂且难以被杀死的微生物，其外膜上存在多种抗原决定簇，能诱导机体产生多种针对不同抗原成分的IgM和IgG类梅毒螺旋体抗体，这些抗体与螺旋体蛋白结合后形成复合物，成为非特异性梅毒螺旋体抗体，从而导致血液中梅毒螺旋体抗体水平长期处于高水平状态，使检测结果呈现阳性。

　　此外，如果患者在治疗期间未遵守医嘱完成整个疗程或出现药物不良反应，则可能影响治疗效果，导致治疗失败。

　　因此，在诊断为梅毒后，应严格遵循医生建议完成整个治疗过程，并定期复查以监测病情变化和治疗效果。