上厕所时包皮过长引起疼痛可能源于龟头炎或尿道口狭窄。

　　龟头炎是指阴茎头部黏膜发生的炎症，可由多种因素引起，如局部刺激、摩擦、外伤等，当患者存在包皮过长的情况时，容易形成包皮垢，刺激龟头黏膜引发炎症反应，从而出现疼痛的症状。而尿道口狭窄则是因为先天发育异常或后天创伤等原因导致尿道口处狭窄，影响尿液排出，此时需要增加腹压才能使尿液排出，所以会出现疼痛感。

　　如果疼痛持续不缓解或者伴有排尿困难、尿频等症状，则可能是由于感染引起的，如膀胱炎、前列腺炎等疾病。这些疾病如果不及时治疗，可能会引起严重的并发症，因此建议患者及时就医进行诊治。

　　在处理上述提及的问题时，应避免使用刺激性强的洗剂清洗患处，以免加重症状。同时保持患部清洁干燥，以促进愈合。