功能性囊肿不伴有包膜，而巧克力囊肿可能有包膜。

　　功能性囊肿通常是生理性的，由卵泡在排卵后形成，没有明显的组织增生，因此没有包膜。而巧克力囊肿则是子宫内膜异位症的一种表现，由于异位的子宫内膜在卵巢中生长，形成囊肿，囊壁可能会发生纤维化，从而形成包膜。

　　除上述两种常见情况外，还应注意是否存在恶性肿瘤引起的卵巢囊肿。此类囊肿通常也没有包膜，且可能伴随腹水、体重下降等症状。

　　针对卵巢囊肿的诊断和治疗，应通过超声检查等影像学评估其结构特征，并结合临床症状综合判断是否为良性或恶性质。建议患者定期复查，以便及时发现任何变化。