贲门癌的鉴别诊断包括贲门痉挛(贲门失弛缓症)食管下段慢性炎症导致的狭窄以及贲门部消化溃疡等贲门痉挛病例的临床特点是年轻病史长吞咽困难病史长但仍能保持中等的健康状况X线食管造影可见对称光滑的贲门上方漏斗形狭窄及其近侧段食管高度扩张
下段食管炎常伴随有裂孔疝及胃液反流病人有长期烧心反酸史体态多矮胖炎症时间长引发瘢痕狭窄出现吞咽障碍X线钡餐表现下段食管贲门狭窄粘膜可以不整食管镜检查见到炎症肉芽和瘢痕肉眼有时与癌不易区分反复多点活检如一直为阴性结果可以确诊