原发性尿道癌的组织类型按其起源部位而有不同
以鳞状上皮癌占多数移行上皮癌次之腺癌较少见
男性尿道舟状窝部覆盖鳞状上皮阴茎部和球部尿道覆盖假复层或柱状上皮后尿道则覆盖移行上皮阴茎部尿道肿瘤50%～70%起自球部约50%继发于远侧的尿道狭窄伴有粘膜鳞状上皮化生因而发生鳞状上皮癌者居多；腺癌则起源于尿道球腺或Lirttre腺尿道球
膜部肿瘤常侵犯会阴部深层结构包括阴茎和阴囊皮肤尿生殖膈和前列腺；舟状窝的肿瘤可侵犯富含血管及淋巴管的阴茎头前尿道肿瘤通常转移至腹股沟浅深淋巴结后尿道肿瘤则转移至闭孔和髂内外淋巴结但当肿瘤侵犯阴茎或会阴部皮肤时则可转移至腹股沟淋巴结尿道癌（尤其是前尿道癌）很少发生务行转移远处转移的部位最多为肺次为肝和胃偶可转移至胸膜和骨
