鉴别诊断需要密切结合病史注意各个发展阶段的病变特点
对于疑难病例需要活组织切片检查
才能最后确定诊断
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与鳞状细胞癌的鉴别有以下几点可供参与：
（1）鳞状细胞癌恶性程度比基底细胞癌为高进展也较快对病程缓慢的病变应首先考虑基底细胞癌反之病程短发展快成菜花样生长的肿块要先考虑鳞状细胞癌
（2）在两种肿瘤都有溃疡形成的情况下首先是基底细胞癌的溃疡外表引人注意：硬底基底较浅而平边缘参差不齐内卷而鳞状细胞癌的溃疡则常深浅不一基底高低不平边缘比较饱满甚至外翻
（3）基底细胞癌含有色素的百分率比鳞状细胞癌者为高对含有色素的病变除色素瘤外要先考虑基底细胞癌鳞状细胞癌的结节表面因含有大量的角化物质所以颜色一般不发黑
（4）基底细胞癌基本上不转移鳞状细胞癌可以通过淋巴管转移至前淋巴结和颌下淋巴结故有淋巴结转移时则要考虑鳞状细胞癌
2与恶性黑瘤的鉴别的鉴别：恶性黑色素瘤病程较短发展较快病变附近色素弥漫血管充盈可在短时间内发展为巨大肿块表面有细小裂痕出现病变很小时即有血水流出
