一般情况下真菌不会侵犯正常角膜但当眼外伤手术或长期局部使用抗生素皮质类固醇以及机体抵抗力下降或角膜炎症后及干眼症等可使非致病的真菌变为致病菌引起角膜继发性真菌感染;或当角膜被真菌污染的农作物如谷物枯草树枝等擦伤及角膜异物挑除后引起真菌感染常见的致病菌以曲霉菌多见其次是镰刀菌白色念珠菌头芽孢菌及链丝菌等