本病的病因尚未完全阐明
现认为本病的发病与感染产生B毒素的Welchii杆菌（C型产气荚膜杆菌）有关
B毒素可致肠道组织坏死产生坏疽性肠炎
在本病发病率颇高的巴布亚新几内亚高原地区研究发现当地居民肠腔内蛋白酶浓度低下这和低蛋白饮食以及当地作为主食的甘薯中所含的耐热性胰蛋白酶抑制因子（heatstable trypsin inhibitors）有关在动物实验中经胃管灌注Welchii杆菌液动物并不致病；但若同时灌注含有胰蛋白酶抑制因子的生甘薯粉或生大豆粉则可致病并产生与急性出血坏死性肠炎相同的组织病理学改变动物实验还证明含有胰蛋白酶的狗胰提取液能防止和减轻本病的发生和发展以上事实提示本病的发生除了进食污染有致病菌的肉类食物外也还有其他饮食因素如饮食习惯突然改变从多吃蔬菜转变为多吃肉食使肠内生态学发生改变有利于Welchii杆菌的繁殖；或如饮食以甘薯为主肠内胰蛋白酶抑制因子的大量存在使B毒素的破坏减少
本病主要病理改变为肠壁小动脉内类纤维蛋白沉着
栓塞而致小肠出血和坏死病变部位以空肠及回肠为多见且严重；有时也可累及十二指肠结肠及胃；少数病例全胃肠道均可受累病变常呈节段性可局限于肠的一段也可呈多发性病变常起始于粘膜表现为肿胀广泛性出血皱襞顶端被覆污绿色的假膜但病变与正常粘膜分界清楚病变可延伸至粘膜肌层甚至累及浆膜病变肠壁明显增厚变硬严重者可致肠溃疡和肠穿孔镜下可见病变粘膜呈深浅不一的坏死改变轻者仅及绒毛顶端重者可累及粘膜全层粘膜下层除有广泛出血外亦可有严重的水肿和炎症细胞浸润肌层及浆膜层可有轻微出血肠平滑肌可见肿胀断裂玻璃样变及坏死血管壁则呈纤维素样坏死也常可有血栓形成肠壁肌神经丛细胞可有营养不良性改变
除肠道病变外尚可有肠系膜局部淋巴结肿大软化；肝脏脂肪变性急性脾炎间质性肺炎肺水肿；个别病例尚可伴有肾上腺灶性坏死
急性结石性胆囊炎的起病是由于结石阻塞胆囊管造成胆囊内胆汁滞留继发细菌感染而引起急性炎症如仅在胆囊粘膜层产生炎症充血和水肿称为急性单纯性胆囊炎如炎症波及到胆囊全层胆囊内充满脓液浆膜面亦有脓性纤维素性渗出则称为急性化脓性胆囊炎胆囊因积脓极度膨胀引起胆囊壁缺血和坏疽即为急性坏疽性胆囊炎坏死的胆囊壁可发生穿孔导致胆汁性腹膜炎胆囊穿孔部位多发生于胆囊底部或结石嵌顿的胆囊壶腹部或者颈部如胆囊穿孔至邻近脏器中如十二指肠结肠和胃等可造成胆内瘘此时胆囊内的急性炎症可经内瘘口得到引流炎症可很快消失症状得到缓解如胆囊内脓液排入胆总管可引起急性胆管炎少数人还可发生急性胰腺炎致病菌多数为大肠杆菌克雷白菌和粪链球菌厌氧菌占10～15％但有时可高达45％
急性非结石性胆囊炎胆囊管常无阻塞多数病人的病因不清楚常发生在创伤或与胆系无关的一些腹部手术后有时也可发生在一些非溶血性贫血的儿童一般认为手术及创伤后的脱水禁食麻醉止痛剂的应用以及严重的应激反应所致的神经内分泌等因素的影响导致胆囊收缩功能降低胆汁滞留和胆囊粘膜抵抗力下降在此基础上继发细菌感染最后造成胆囊的急性炎症也有认为部分病例是胆囊的营养血管发生急性栓塞所引起此类急性非结石性胆囊炎的病理演变与结石性胆囊炎相似但病程发展迅速一般在24小时内即发展成坏疽性胆囊炎并表现为整个胆囊的坏疽
