可以引起播散性疱疹疱疹性脑膜炎前列腺炎直肠炎盆腔炎脊髓神经根疾病等一系列并发症在艾滋病流行的地区该病还可增加艾滋病病毒感染的危险性
部分生殖器疱疹病毒HSV1可能经周围神经沿神经轴转入三叉神经节HSV2则转入骶神经节长期潜伏于神经细胞内如机体受到创伤高热过敏月经等原因引起感染和复发时会并发腰髓部神经炎脊髓炎出现臀部及下肢放射性疼痛膀胱麻痹等症另外生殖器疱疹常与其他性传播疾病如淋病非淋菌性尿道炎梅毒尖锐湿疣阴道念珠菌病滴虫等混合感染故在诊治中应该加以重视