由于本病的临床表现多样常易与其他疾病混淆以发热为主要表现而心脏体征轻微者须与伤寒结核上呼吸道感染肿瘤胶元组织疾病等鉴别在风湿性心脏病基础上发生本病经足量抗生素治疗而热不退心力衰竭不见好转应怀疑合并风湿活动的可能此时应注意检查心包和心肌方面的改变如心脏进行性增大伴奔马律心包摩擦音或心包积液等但此两病也可同时存在发热心脏杂音栓塞表现有时亦须与心房粘液瘤相鉴别
本病以神经或精神症状为主要表现者在老年人中应注意与脑动脉硬化所致脑血栓形成脑溢血及精神改变相鉴别