功能性消化不良主要应与下列器质性病变相鉴别：
①消化性溃疡：消化性溃疡是指发生在胃或十二指肠球部的溃疡
在临床上消化性溃疡也可以表现为上腹部疼痛
饱胀感嗳气反酸水烧心恶心呕吐食欲减退等消化不良的症状
但上消化道钡餐透视可发现有突出到胃壁内的叫做“龛影”的不透光影胃镜检查更能直接看到溃疡病灶的大小及溃疡周围炎症的轻重
②慢性胆囊炎和胆石症：慢性胆囊炎或胆石症者常有右上腹部的疼痛和饱胀感嗳气等消化不良的症状有些患者可有反复发作的急性上腹部绞痛史(此即所谓胆绞痛)通过腹部B型超声检查以及胆囊造影结合曾经反复发作的上腹部绞痛常能作出诊断
③胃癌：胃癌的早期常无特异的症状只有胃镜和病理检查才能发现但随着肿瘤的不断增长影响到胃的功能时会出现消化不良的类似症状在临床上主要表现为上腹部疼痛或不适感食欲减退恶心呕吐等但胃癌的发病年龄多在40岁以上会同时伴有消瘦乏力贫血等提示恶性肿瘤的所谓“报警”症状通过胃镜检查及活组织病理检查不难确诊
