㈠饮食因素：运用测定细菌酶类的方法研究菌丛代谢活性的结果表明
饮食可使粪便菌丛发生明显改变
无纤维食物能促进细菌易位Spaeth G用大鼠作试验研究结果表明食物纤维能维持肠道菌群正常生态平衡且细菌代谢纤维的终产物对小肠上皮有营养作用纤维能维持肠粘膜细胞的正常代谢和细胞动力学Hosoda等报道加入纤维的低渣饮食对保存肠的结构和功能有好的效果纤维的保护作用是否通过直接刺激激肠粘膜或诱导释放营养性胃肠激素尚不清楚食物纤维能减少细菌易位但不能使屏障功能恢复至正常
㈡菌丛的变化因素：菌丛组成可因个体不同而存在差异但对同一个人来说在相当长的时期内菌丛组成十分稳定每个菌种的生态学地位由宿主的生理状态
细菌间的相互作用和环境的影响所确定在平衡状态下所有的生态学地位都被占据细菌的暂时栖生可使生态平衡发生改变
㈢药物的代谢因素：肠道菌丛在许多药物的代谢中起重要作用包括乳果糖水杨酸偶氮磺胺吡啶左旋多巴等任何抗生素都可导致结肠菌丛的改变其取决于药物的抗菌谱及其在肠腔内的浓度氯林可霉素和氨苄青霉素可造成大肠内生态学真空状态使艰难梭菌增殖应用甲氰咪胍等H2—受体拮抗剂可导致药物性低胃酸和胃内细菌增殖
㈣年龄因素：随着年龄的增高肠道菌群的平衡可发生改变双尾菌减少产气荚膜杆菌增加前者有可能减弱对免疫机能的刺激后者导致毒素增加使免疫受到抑制老年人如能维持年青时的肠道菌群平衡也许能够提高免疫能力
㈤胃肠道免疫功能障碍因素：胃肠道正常免疫功能来自粘膜固有层的浆细胞浆细胞能产生大量的免疫球蛋白即分泌型IgA此为胃肠道防止细菌侵入的主要物质一旦胃肠道粘膜合成单体或双体IgA或合成分泌片功能发生障碍致使胃肠道分泌液中缺乏分型IgA则可引起小肠内需氧菌与厌氧菌过度繁殖从而造成菌群失调引起慢性腹泻无症状的IgA缺乏者小肠内菌群亦可过度繁殖新生儿期菌群失调发生率较高亦可能与免疫系统发育未成熟或不完善有关
㈠细菌生长过盛：胃肠道的解剖和生理学异常会导致近段小肠内结肠型丛增殖而出现各种代谢紊乱包括脂肪泻维生素缺乏和碳水化合物吸收不良并可伴发生于小肠假性梗阻硬皮病糖尿病性植物神经病变慢性营养不良等小肠内细菌生长过盛其多种厌氧菌（主要有类杆菌双岐杆菌韦荣氏球菌肠球菌和梭状芽胞杆菌）能水解结合胆盐导致微胶粒形成障碍肝硬化无明显代谢紊乱的低胃酸症等结肠菌丛的改变能导致因广泛小肠切除后伴有神经功能不全的D-乳酸性酸中毒应用广谱抗生素尤其是氯林可霉素和氨苄青霉素能使艰难梭菌增殖产生一种蛋白质霉素引起结肠粘膜坏死和溃疡称为假膜性结肠炎
㈡细菌产生IgA分解酶：溶血性链球菌属绿色链球菌肺炎链球菌属流感嗜血杆菌属脑膜炎双球菌淋病双球菌属等菌能够产生分解IgA的蛋白酶并能分解人血清中的IgA1和初乳中的分泌型IgA其中前2例细菌是构成口腔内菌群的主要菌种后4种则为附着粘膜表面增殖的毒力性强的致病菌由此可见IgA蛋白酶对于这些细菌在粘膜表面作为常住菌生存或致病都是至关重要的
㈢肠道丛与结核癌：结肠菌丛产生多种具有代谢活性的酶类在一些自然产物食物保存剂染料添加剂及污染物质变为致突变物质的反应中起媒介作用许多细菌可因长期接触底物而使细菌酶系系统活性增高若此底物为致癌物原（procarcinogen）则长期接触可使致癌物质的产生增加
