（1）肾脏癌肿：呈占位性病变
但易发于深部从而引起更明显的肾盏弯曲
血尿常见而囊肿则不见当肾实质肿瘤压在腰大肌上面在腹平片上就看不到肌肉的边缘而囊肿则依旧可见出现转移的证据（如体重减轻
乏力触及锁骨上淋结肿大胸片显示有转移性结节）红细胞增多症高钙血症及血沉加快都提示为癌肿需记住的是囊肿壁也会发生癌性变若肾静脉被癌肿堵塞排泄性尿路造影就不清楚甚或不显影超声影象及CT总是最后用来做鉴别诊断血管造影及肾断层X光摄影术可显示在含丰富血管的肿瘤中有一造影剂密集的“池塘”而囊肿密度则不受影响在被证明是其他疾病前将所有肾脏占位性病变都假定为癌肿是明智的
（2）多囊肾：正如尿路造影所示本病几乎总是双侧性的弥漫的肾盏及肾盂发生扭曲已成其规律单纯性肾囊肿则多为孤立性单发性多囊肾往往伴有肾功能损害及高血压而肾囊肿则没有
（3）肾痈：本病罕见采集病史时可发现在突起发热及局部疼痛前数周有过皮肤感染史尿路造影显示其病变与囊肿及肿瘤相似但由于肾周围炎影响使肾轮廓及腰大肌影模糊不清此时肾脏多较固定将患者在仰卧及直立时肾脏位置加以比较即可证实血管造影可显示一无血管的病损镓-67扫描可显示病损的炎症性质但感染的单纯性肾囊肿也可有相似的表现
（4）肾积水：症状和体征可与单纯性肾囊肿的表现完全一致但尿路造影则截然不同囊肿引起肾脏变形而肾积水则表现为由于梗阻所致的肾盏和肾盂的扩张急性或亚急性肾盂积水由于肾盂内压的增高常产生更为局限的疼痛并因感染而易于使其表现复杂化
（5）肾外肿瘤（如肾上腺混合性后腹膜肉瘤）：可使肾脏移位但很少侵及肾脏并使肾盏变形
（6）能包虫病：其囊肿未与肾盂相通时难以和单纯性肾囊肿鉴别因尿中尚不会有包虫及其幼虫在X线检查中常发现肾包虫病囊肿壁上有钙化皮肤敏感试验时诊断该病有所帮助
