从痰液或经纤支镜刷取物以及支气管灌洗液的镜检和病原体培养
活检肺组织以及血清学检查等有助于辨明感染的病原体
（一）细菌性肺炎
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需氧革兰染色阳性球菌如肺炎链球菌（即肺炎球菌）金黄色葡萄球菌甲型溶血性链球菌等
2需氧革兰染色阴性菌如肺炎克雷白杆菌流感嗜血杆菌埃希大肠杆菌绿脓杆菌等
3厌氧杆菌如棒状杆菌梭形杆菌等
（二）病毒性肺炎 如腺病毒呼吸道合胞病毒流感病毒 麻疹病毒巨细胞病毒单纯疱疹病毒等
（三）支原体肺炎 由肺炎支气体引起
（四）真菌性肺炎 如白色念珠菌曲菌放线菌等
（五）其他病原体所致肺炎 如立克次体（如Q热立克次体）衣原体（如鹦鹉热衣原体）弓形体（如鼠弓形体）原虫（如卡氐肺孢子虫）寄生虫（如肺包虫肺吸虫肺血吸虫）等机体免疫力低下者（如艾滋病患者）容易伴发肺部卡氏肺包子虫军团菌鸟形分支杆菌结核菌弓形体等感染
