病因未明
推测与几方面因素有关：如大量粉尘吸入（铝二氧化硅等）机体免疫功能下降（尤其婴幼儿）遗传因素酗酒微生物感染等
而对于感染有时很难确认是原发致病因素还是继发于肺泡蛋白沉着症例如巨细胞病毒卡氏肺孢子虫组织胞浆菌感染等均发现有肺泡内高蛋白沉着
虽然启动因素尚不明确但基本上同意发病过程为脂质代谢障碍所致即由于机体内
外因素作用引起肺泡表面活性物质的代谢异常到目前为止研究较多的有肺泡巨噬细胞活力动物实验证明巨噬细胞吞噬粉尘后其活力明显下降而病员灌洗液中的巨噬细胞内颗粒可使正常细胞活力下降经支气管肺泡灌洗治疗后其肺泡巨噬细胞活力可上升而研究未发现Ⅱ型细胞生成蛋白增加全身脂代谢也无异常因此目前一般认为本病与清除能力下降有关
