本病的病因尚不清楚
有自体免疫学说
脑循环障碍说发育缺陷说等三种学说
1自体免疫学说：在克汀病人的血液中被证明有高效价甲状腺抗体;甲状腺功能减退起免疫作用的主要是淋巴细胞提示B淋巴细胞和T淋巴细胞系统其抗原抗体产生异常
2脑循环障碍说：据研究在甲状腺素不足或缺乏时代谢发生障碍使脑血流量减少血管阻力增大因而氧耗量和葡萄糖耗量都减少导致脑缺氧和糖代谢障碍脑水肿可能与精神活动减退有关;心脏和其他器官也出现低氧血症
3发育缺陷说：有研究发现患者脑的蛋白合成和脂肪合成都有异常并有细胞发育不良和髓鞘形成的缺陷
