需与下列疾病鉴别
尤其对产前感染性肺炎更属重要
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肺透明膜病 由于缺乏肺表面活性物质呼吸困难发生在出生后12小时以内逐渐加重病情进展较产前肺炎稍慢但这两种疾病常不易从临床X线片以及病理上鉴别因此对肺透明膜病也可试作产前感染性肺炎（特别是B组链球菌肺炎）治疗采用较大剂量青霉素
2缺氧缺血性脑病 在足月儿本症多由于窒息引起在早产儿则不一定有缺氧史发病开始即出现呼吸不规则肌张力增高或降低有时发生惊厥但产前肺炎起病稍晚神经系统症状较少
3先天性心脏病 一般需与复杂的先心或出生后不久即出现青紫的先心鉴别先心在生后数天内出现呼吸增快或青紫心脏有时可听到杂音而肺部无啰音胸部X线片可资鉴别
4横膈疝 腹腔内脏经过疝孔进入胸腔压迫心肺引起肺发育不良出现气促胸部X线片可帮助鉴别
5巨细胞病毒引起的肺炎 起病缓慢症状有发热干咳气促胸部X线片为典型的间质性肺炎这些和衣原体肺炎相似但巨细胞包涵体病患儿肝脾肿大明显有时伴黄疸
