鉴别诊断大都属于两种情况
第一类为惊厥的鉴别诊断
详情可参阅惊厥章在新生儿时期鉴别时须特别注意生产性损伤
先天性脑部发育不全及败血症等若为较大的婴儿须特别注意各种急性病（如肺炎上呼吸道感染）起病时的脑症状脑炎热度不高的脑膜炎（如结核性脑膜炎偶遇脑膜炎球菌脑膜炎亦可暂时缺乏高热）婴儿痉挛症低血糖症以及铅中毒等在儿童时期尚须与癫痫及甲状旁腺功能低下相鉴别
第二类为喉部梗阻的鉴别诊断（详见呼吸系统疾病篇喉梗阻节）手足搐搦症的喉痉挛以吸气性哮吼为主要症状若同时并无惊厥则可利用佛斯特氏征等以助诊断
从病因来说婴儿性手足搐搦症主要是由于维生素D的不足而致血钙低落还有其他不同病因的手足搐搦症如低镁性和碱中毒性手足搐搦症等在临床表现上和婴儿性手足搐搦症相同因此有必要对此等不同病因的手足搐搦症做出鉴别对每一个手足搐搦病例应仔细研究临床上有关的问题其中最重要的一点就是：佝偻病的存在为维生素D缺乏性手足搐搦症的特征现将维生素D缺乏性手足搐搦症以外的各种手足搐搦症略述如下以作鉴别应当注意有时在一个病例中可能有几个病因同时存在
1甲状旁腺功能不全所致的手足搐搦症如在进行甲状腺手术时误切了甲状旁腺可使甲状旁腺素缺乏而致血钙低落新生儿可能有暂时性甲状旁腺功能不足现象因为在胎儿时期母亲的甲状旁腺功能加强不需要胎儿的甲状旁腺发生作用这种被动性的低功能现象在产后可保持数日亦有人认为新生儿的甲状旁腺功能虽正常但人体对甲状旁腺的调节作用反应较差以致血钙不能维持正常水平新生儿如用牛奶喂养由于牛奶中磷的含量较高以致钙不易吸收血钙降低终于发生手足搐搦此外还有原发性或原因不明的甲状旁腺功能不全症以上三种病例都有一个共同的血生化特征即血磷增高血钙减低碱性磷酸酶正常应以双氢速固醇（Dihydrotachysterol）或甲状旁腺激素治疗
2碱中毒性手足搐搦症 由于长期呕吐或反复洗胃而发生低氯性碱中毒由于水杨酸中毒等所致的呼吸深长发生呼吸性碱中毒或由于输液不当静脉点滴大量碳酸氢钠等都可使钙离子（Ca++）浓度下降而发生症状
3低镁性手足搐搦症 以肌肉抽动或惊厥为其症状比较少见易见于早产儿及小样儿母亲往往有妊娠中毒症糖尿病甲状腺亢进症偶见于用枸椽酸盐抗凝的血液换血的新生儿溶血症患儿此时血液内镁和钙均降低而出现手足搐搦症（血清镁正常值为0.74～1.25mmol/L（1.48～2.5mEq/L））也可由于腹泻迁延过久或因酶的缺乏而致肠吸收不良等影响镁的吸收亦有由于醛固酮增多症或原发性低血镁而发生惊厥者患者血清镁降至0.74mmol/L（1.48mEq/L）以下出现面肌抽动手足徐动血压高心动过速等经补钙无效但注射或口服镁剂后即可控制症状
4慢性肾脏病过程中继发的手足搐搦症由于肾功能不全肾小管排磷的功能减低血磷增高以致血钙降低此类疾病多有白蛋白减低或慢性酸中毒故很少发生手足搐搦症但当血清钙极度减低或因输入碱性溶液使血清pH值上升时即可出现惊厥或手足搐搦的症状
5低钠血症和高钠血症 治疗脱水时如补钠不足或因水分摄入过多而出现低钠血症则发生嗜睡呕吐惊厥等神经症状如婴幼儿腹泻患儿在脱水及酸中毒纠正过程中虽未发生碱中毒血钙也无明显降低但当血钠上升血钾下降时出现高钠血症可发生手足搐搦的症状新生儿窒息或呼吸窘迫综合征时如输入大量碳酸氢钠液也可发生高钠血症而出现惊厥
6.维生素B6缺乏症和依赖症 幼婴时期如缺乏维生素B6或发生维生素B6依赖症亦可出现抽搐
