肠结核一般都由人型结核杆菌引起偶有因饮用带菌牛奶或乳制品罹患牛型结核者结核杆菌侵犯肠道的主要途径有:
一胃肠道感染 为肠结核的主要感染方式
二血行播散 血行播散也是肠结核的感染途径之一见于粟粒型结核径血行播散而侵犯肠道
三邻近结核病灶播散 肠结核还可由腹腔内结核病灶直接蔓延而引起如输卵管结核结核性腹膜炎肠系膜淋巴结核等此种感染系通过淋巴管播散